К началу XIX в. все здания обители, кроме собора, оставались деревянными. Строитель Иларион задумал сделать весь монастырь каменным. Все работы велись на средства благотворителей.
К 1812 году строительство западной части монастырского каре было завершено, началась постройка северной и южной сторон. В северо-западной башне находился хлебный запас, в юго-западной — кладовая для провизии, квасоварня с погребом. В средней части обеих линий застройки возвышаются 2-х этажные братские келейные корпуса, соединяющиеся с угловыми башнями одноэтажными зданиями, в которых размещались мастерские.
В восточной стороне монастырского каре располагались братские кельи, монастырская библиотека, аптека и небольшой музей.
В двух угловых башнях монастырского каре были устроены церкви. В северо-восточной башне расположился храм во имя преподобного Арсения Коневского, а в юго-восточной башне — храм во имя святого Николая Чудотворца.
Комплекс работ по сохранению объекта культурного наследия: